1999年，13.7米毫米波射电天文望远镜获国家科学技术进步奖二等奖。

2002年，13.7米毫米波射电天文望远镜获蔡冠深基金观测二等奖。

2004年，13.7米毫米波射电天文望远镜获蔡冠深基金观测二等奖。

2005年，“3毫米波段多谱线接收系统”获青海省科技进步一等奖。

2006年，“3毫米波段多谱线接收系统”获国家科技进步二等奖。

2009年，中科院南京分院授予青海观测站“创新文化建设先进团队”称号。

2009年，科技部授予青海观测站“全国野外科技工作先进集体”荣誉。

2010年，海西州精神文明建设指导委员会授予“海西州未成年人思想道德建设优秀活动基地”称号。